Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Apoc1P34928 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms