Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxc10P31257 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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