Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cd28P31041 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cd28P31041 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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