Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccnd3P30282 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms