Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprmP28828 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PtprmP28828 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PtprmP28828 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms