Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col2a1P28481 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms