Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb1P28230 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb1P28230 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gjb1P28230 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gjb1P28230 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms