Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pde6aP27664 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms