Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
NdnP25233 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
NdnP25233 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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NdnP25233 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
NdnP25233 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
NdnP25233 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms