Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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RarbP22605 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RarbP22605 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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RarbP22605 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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RarbP22605 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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RarbP22605 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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RarbP22605 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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RarbP22605 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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