Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Fcer1aP20489 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Fcer1aP20489 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Fcer1aP20489 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms