Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PrkcaP20444 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms