Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PdgfaP20033 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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