Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
NelfeP19426 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms