Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
P18525 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
P18525 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18525 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18525 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18525 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18525 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18525 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18525 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
P18525 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
P18525 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms