Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Vpreb1P13372 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms