Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CatspereP0DP43 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms