Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprqP0C5E4 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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