Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
LtaP09225 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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LtaP09225 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
LtaP09225 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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LtaP09225 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LtaP09225 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms