Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Eb1P04230 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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