Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P04213 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P04213 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P04213 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P04213 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P04213 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P04213 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P04213 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P04213 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P04213 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P04213 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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