Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Vamp8O70404 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms