Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SlkO54988 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SlkO54988 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SlkO54988 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SlkO54988 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms