Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrxO54751 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrxO54751 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrxO54751 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms