Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sdc4O35988 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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