Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cited2O35740 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms