Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Cnih1O35372 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cnih1O35372 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cnih1O35372 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cnih1O35372 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cnih1O35372 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cnih1O35372 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Cnih1O35372 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih1O35372 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Cnih1O35372 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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