Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sema3aO08665 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms