Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm6871L7N248 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm6871L7N248 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms