Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm9602J3QPD5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms