Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Smim22J3QP37 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Smim22J3QP37 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms