Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm28051J3QMA2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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