Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20834J3QM72 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms