Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm21818J3KMS6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm21818J3KMS6 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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