Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm29394H3BIW7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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