Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vmn1r58G3X9U3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms