Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Srp72F8VQC1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms