Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3443F7CCV5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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