Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Dync1i1-201ENSMUST00000115554 2518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 9930111H07Rik-201ENSMUST00000187270 821 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Sfmbt1-202ENSMUST00000112184 2936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pdgfrb-202ENSMUST00000115274 5423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pakap-203ENSMUST00000150412 5163 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 3930402G23Rik-201ENSMUST00000040608 3086 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Gm37120-201ENSMUST00000193350 5959 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Gm20538F6Z9R1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms