Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmgcF6VRN1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmgcF6VRN1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmgcF6VRN1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmgcF6VRN1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmgcF6VRN1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SmgcF6VRN1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SmgcF6VRN1 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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