Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm5861F6VCN9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Gm5861F6VCN9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm5861F6VCN9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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