Protein–RNA interactions for Protein: F6URP1

Gm6619, Predicted gene 6619, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6619F6URP1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm6619F6URP1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms