Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm21977F6U3N7 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Gm21977F6U3N7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms