Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lmod3E9QA62 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lmod3E9QA62 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms