Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Rnf169E9Q7F2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rnf169E9Q7F2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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