Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm20425E9Q035 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms