Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rsph10bE9PYQ0 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rsph10bE9PYQ0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms