Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc8E9PWG2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms