Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb3D3Z6J4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms