Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms